Элис с группой своих клонов совершает нападение на штаб-квартиру корпорации "Амбрелла", расположенную в защищенном подземном бункере под улицами Токио. Уничтожается весь персонал и охрана комплекса, но в последний момент председатель корпорации - Альберт Вескер спасается на одном из боевых вертолетов. Активировав систему самоуничтожения подземного комплекса, он тем самым уничтожает всех клонов Элис. Сама же она совершает безуспешную попытку убить Вескера в вертолете. Он вводит ей препарат, выводящий из организма Т-вирус, превращая Элис снова в обычного человека. Но, Вескер не успевает ее убить, вертолет терпит крушение в окресностях Токио. В выживших остается одна Элис. (Возможно на борту был ещё один клон)
Позже Элис отправляется на самолете в единственное не пораженное вирусной инфекцией место - город "Аркадия" на Аляске, куда ранее улетели ее друзья. На месте она понимает, что не существует никакого города - здесь только пустырь, полный прилетевших на сигнал самолетов и вертолетов без людей. Там же она находит Клэр Рэдфилд с прикрепленным на ее грудь контроллером-скарабеем, созданным "Амбреллой", который стирает память носителя и подчиняет его корпорации.
Клэр и Элис вылетают в уничтоженный Лос-Анджелес, где обнаруживают несколько выживших, укрывшихся на крыше городской тюрьмы. Так как улицы города по-прежнему кишат толпами зомби, Элис принимает рискованное решение приземлиться непосредственно на крышу здания. Выжившие в начале думали, что самолет прилетел с "Аркадии", сигнал которой они также получают по радио. Позже выясняется, что "Аркадия" является не городом, а кораблем, в настоящее время находящимся у берегов Лос-Анджелеса. В глубине тюрьмы Клэр находит своего брата Криса Рэдфилда, запертым в одной из камер во время бунта заключенных. Позже к воротам тюрьмы подходит палач, являющимся одним из эксперементов "Амбреллы", как и зомби-копатели (маджини) и новый вид собак(адьюлы). Он пытается проломить ворота. У выживших не остается выбора, как выпустить Криса. Он рассказывает им о БТРе, на котором можно спастись и о складе с оружием. Но в машине нет двигателя. как только Элис и Крис добывают оружие, они решают выбраться через тоннель, проделанный зараженными. Тут же врывается палач, которого побеждают Элис и Клэр.
Выжившие покидают тюрьму и отправляются через канализацию к побережью, откуда отплывают на "Аркадию". Выясняется, что корабль принадлежит "Амбрелле", где также проводятся эксперименты над людьми. В одном из помещений корабля Элис находит Альберта Вескера, который и рассказывает ей конечную цель экспериментов. Т-вирус, дает ему сверхчеловеческую скорость и силу, но является очень нестабильным, стремящимся поглотить остатки человеческой ДНК Вескера. Для поддержания стабильного состояния необходимы регулярные инъекции препаратов с ДНК незараженных людей, для поиска которых и был создан этот корабль.
В ходе последующей схватки Элис, Клэр и Крис Рэдфилд расстреливают Вескера и запирают его тело в отсеке корабля, что не мешает ему всего через пару минут сбежать с "Аркадии" на боевом вертолете. Вескер также, как и в Японии активирует систему уничтожения корабля, но обнаруживает бомбу у себя в вертолете, предусмотрительно установленную Элис. Мощный взрыв полностью уничтожает вертолет. На фоне мельком виден спускающийся парашют.
В заключительных кадрах фильма Элис обновляет сигнал корабля "Аркадия", на что немедленно реагирует "Амбрелла", высылая десятки своих боевых вертолетов под командованием Джилл Вэлентайн, на перехват выживших (на груди Джилл такой же паук, что контролировал Клэр).
(с) Вики
